Broadwick : 계산 토토사이트을위한 프레임 워크

인용

O'Hare A, Lycett SJ, Doherty T, Salvador LCM & Kao RR (2016) Broadwick : 컴퓨터 토토사이트을위한 프레임 워크.BMC 생물 정보학, 17 (1), Art. 아니오 : 65. https://doi.org/10.1186/S12859-016-0903-2

Abstract
배경  질병 발생 모델링에는 종종 현대 발병 중에 수집 된 풍부한 데이터를 복잡한 수학적 또는 계산 전송 모델에 통합하는 것이 포함됩니다. 이러한 데이터를 간단한 구획 토토사이트 모델에 통합하는 것은 종종 어려운 일이므로보다 복잡하지만보다 효율적인 계산 모델을 사용해야합니다. 이 논문에서 우리는 질병 데이터를 효율적으로 처리하고 일반적으로 이러한 모델과 관련된 보일러 플레이트 코드를 줄이는보다 체계적이고 사용자 친화적 인 토토사이트 모델을 구축하고 실행하는 새로운 프레임 워크를 소개합니다. 예를 들어 간단한 네트워크에서 SIR 모델을 개발하여 프레임 워크를 소개합니다.  결과  우리는 대형 토토사이트 데이터 세트를 효율적으로 처리하고 확률 적 시뮬레이션을위한 패키지, 대략적인 베이지안 계산 (ABC) 및 Markov Chain Monte Carlo (MCMC) 방법을 사용한 매개 변수 추론을 제공하는 모듈 식 객체 지향 토토사이트 프레임 워크 인 Broadwick을 개발합니다. 사용 된 각 알고리즘은 필요에 따라 사용자 정의 알고리즘으로 쉽게 재정의되는 현명한 기본값으로 완전히 사용자 정의 할 수 있습니다.  결론  Broadwick은 복잡한 모델을 개발하고 공유 할 수있는 일반적인 프레임 워크를 제공함으로써 연구원의 생산성을 높이기 위해 개발 된 토토사이트 모델링 프레임 워크입니다. 그것은 질병 발생 전에 모델을 만들 수 있고 토토사이트 모델링에서 일반적으로 발견되는 대형 데이터 세트를 처리 할 수있는 능력을 가지고 있기 때문에 연구 팀 리더에게 호소 할 것입니다..

키워드
토토사이트; 모델링; 뼈대; 모듈성

저널
BMC 생물 정보학 : 17 권, 문제 1

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